Manta Oyamada est un adolescent de treize ans, bon élève, mais complexé par sa petite taille et d'un caractère assez difficile. Un soir, en rentrant de l'école, il passe par le cimetière pour prendre un raccourci et voit un autre garçon qui semble observer les étoiles. Celui-ci l'interpelle et l'invite à partager cette belle nuit avec lui et avec ses amis les fantômes! Pris de panique, Manta s'enfuit en hurlant. Bien entendu., lorsqu'il raconte cela à ses camarades de classe le lendemain, personne ne le croit. C'est alors que leur professeur leur annonce l'arrivée d'un nouvel élève dans leur classe. Quelle n'est pas la surprise de Manta de reconnaitre le garçon de la veille! Celui-ci, qui s'appelle Yoh Asakura, ne parait pas se souvenir de lui. Manta, qui veut en avoir le coeur net, suit Yoh à la sortie de l'école. Celui-ci lui dévoile alors son secret: c'est un Shaman, qui a la faculté de communiquer avec les esprits et d'utiliser leurs pouvoirs en se faisant posséder par eux. Manta a du mal à accepter cette révélation, jusqu'au jour où il voit de ses propres yeux Yoh se défaire de Ryû, le chef d'une bande de voyous qui s'est installée dans le cimetière, avec l'aide d'Amidamaru, un samouraï mort il y a 600 ans...